為利掌握委任(辦)機關管理國際級及國家級重要濕地的品質，將透過「自主評核」及「現地評鑑審查」之方式進行評鑑考核工作，於執行期間除了進行現地訪視、督導之外，另將進行評核工作，請各委任(辦)機關配合提供所需資料進行經營成效評核。

一、第一階段審查：
(一)初審評核表填報繳回：於發函後15日內完成，並函覆評核表。
(二)複審評核：於各國家公園管理處及直轄市及縣(市)政府函覆評核表後10日內完成，與初審評核表格加總評核分數加總後，依評核總分排序擇優選取15％~20％評鑑濕地公告進入第二階段現地評鑑濕地名單。
二、第二階段審查(現地評鑑審查)：
於第一階段審查考核完成後3個月內擇期辦理（將俟評核委員可出席時間調整）。